ประวัติศาสตร์ของ Middlesex University เริ่มต้นขึ้นในช่วงปี 1880s เมื่อสถาบันการศึกษาสองแห่งทางตอนเหนือของลอนดอน ได้แก่ St Katherine's College และ Hornsey School of Arts and Crafts ได้รวมกันเป็น Middlesex Polytechnic ซึ่งก่อตั้งอย่างเป็นทางการในปี 1973

Middlesex University เป็นหนึ่งในมหาวิทยาลัยที่มีคุณภาพทางด้านงานวิจัยเป็นอันดับต้นๆ ในกลุ่ม modern universities ในลอนดอน มหาวิทยาลัยได้รับถึงสามรางวัลทางด้านนวัตกรรมการศึกษาจาก Queen’s Anniversary Prizes for Higher and Further Education มหาวิทยาลัย Middlesex ยังได้รับรางวัล Queen’s Award for Enterprise อีกด้วย

Middlesex University มีนักศึกษาต่างชาติมากถึง 5,500 คน จาก 130 ประเทศทั่วโลก ซึ่งจำนวนนี้ทำให้มหาวิทยาลัยเป็นหนึ่งในมหาวิทยาลัยในลอนดอนที่มีนักศึกษาต่างชาติมากที่สุดแห่งหนึ่ง และยังให้ Middlesex University เป็นมหาวิทยาลัยที่ใหญ่ที่สุดแห่งหนึ่งในสหราชอาณาจักรอีกด้วย มหาวิทยาลัยมีแคมปัสทั้งหมดห้าแห่ง ซึ่งสามแห่งตั้งอยู่ในลอนดอน หนึ่งแห่งตั้งอยู่ที่ดูไบ และอีกหนึ่งแห่งตั้งอยู่ที่มอริเชียส